Departamentas, siekdamas jam nustatytų uždavinių, atlieka šias funkcijas:
5.1. padeda NBFC direktoriui organizuoti centralizuotą įstaigų personalo administravimo funkcijų atlikimą;
5.2. organizuoja įstaigų personalo priėmimo ir skyrimo į pareigas, perkėlimo į kitas pareigas ir atleidimo procedūras, rengia susijusių teisės aktų projektus ir kitus dokumentus;
5.3. rengia teisės aktų projektus ir kitus dokumentus dėl įstaigų personalo atostogų, papildomų poilsio dienų suteikimo, komandiruočių, dalyvavimo mokymuose, skatinimo, tarnybinių nuobaudų skyrimo, sprendimų dėl darbo pareigų pažeidimo, leidimų dirbti kitą darbą išdavimo, materialinių pašalpų skyrimo ir kitų personalo klausimų;
5.4. organizuoja valstybės tarnautojo pažymėjimų, valstybės pareigūno pažymėjimų bei darbuotojų, dirbančių pagal darbo sutartis, pažymėjimų išdavimą;
5.5. padeda įstaigos vadovo sudaromų komisijų, susijusių su personalo valdymu, pirmininkams organizuoti šių komisijų darbą;
5.6. organizuoja įstaigų personalo veiklos vertinimą ir rengia susijusių teisės aktų projektus bei kitus dokumentus;
5.7. išduoda pareigūnams siuntimus atlikti specializuotąją medicininę ekspertizę;
5.8. užtikrina Darbo kodekso nuostatų įgyvendinimą NBFC;
5.9. teikia valstybės ir savivaldybių institucijoms, įstaigoms ir įmonėms, fiziniams ir juridiniams asmenims, kitoms organizacijoms ir jų padaliniams informaciją Departamento kompetencijos klausimais;
5.10. analizuoja ir sistemina informaciją apie centralizuoto personalo administravimo procesus, rengia personalo administravimo funkcijų įgyvendinimo gerosios praktikos apibendrinimus ir teikia politiką šioje srityse formuojančioms institucijoms pasiūlymus dėl centralizuoto personalo administravimo procedūrų optimizavimo ir jų reglamentavimo tobulinimo;
5.11. teikia metodinę pagalbą įstaigoms, kurių personalo administravimo funkcijas centralizuotai atlieka NBFC, rengia personalo administravimo funkcijų įgyvendinimo rekomendacijas ir gaires;
5.12. sudaro, tvarko įstaigų personalo asmens bylas ir kitas archyvines bylas personalo klausimais bei organizuoja jų perdavimą archyvui;
5.13. organizuoja ir kontroliuoja skundų, pranešimų, kitos gautos informacijos apie galimus drausminius nusižengimus, darbo pareigų ir etikos pažeidimus tyrimą, analizuoja nustatytus drausminius nusižengimus, teikia pasiūlymus dėl jų prevencijos;
5.14. dalyvauja rengiant NBFC metinį veiklos planą;
5.15. atlieka kitas Lietuvos Respublikos įstatymais ir kitais teisės aktais, vidaus teisės aktais nustatytas funkcijas, NBFC direktoriaus, jo pavaduotojo pavestas užduotis Departamento kompetencijos klausimais.